В сентябре климат в Токтамысе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Токтамысе 18 ясных, 11 с переменной облачностью и дождливый день. Дожди преимущественно слабые.