В сентябре климат в Усть-Коксе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Усть-Коксе 12 ясных, 11 дождливых и 7 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Усть-Кокса cчитается местом, некомфортным для посещения.