В сентябре климат в Якшине можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Якшине 15 пасмурных, 14 дождливых и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Якшино cчитается местом, некомфортным для посещения.