В сентябре климат в Жохсогонском наслеге можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Жохсогонском наслеге 15 пасмурных, 6 ясных, 5 с переменной облачностью и 4 дождливых дня. Дожди преимущественно умеренные.