Y хромосома человека не обменивается участками (не рекомбинирует) с Х хромосомой за исключением небольших псевдоаутосомных участков (< 5%). В Y хромосоме, как и в других участках генома, происходят случайные мутации, которые достаточно редки.
По модулю вышесказанного, можно считать, что Y хромосома передаётся от отца сыновьям в неизменном виде. На этом построен анализ происхождения по отцовской линии, ДНК идентификация и тд.