Я никогда не встречал этого слова, однако полагаю, что его появление связано с попыткой заменить не вполне удобный для лингвистики термин "абзац". Почему он является неудобным? - Все просто. Этот термин является типографским. А типографское деление текста на части больше определяется эстетикой печатного текста, чем его тематическим делением. Зрительное восприятие человека отрицательно реагирует на однообразие, поэтому большие по объему, средние и короткие абзацы должны рационально чередоваться. Вот почему абзац и некое небольшое тематическое целое не всегда совпадают по содержанию. К тому же термин "абзац" оказывается не у дел, если речь заходит об устном тексте. Термин "микротема", как мне кажется, призван обратить внимание лингвиста именно на тематическое (а не на эстетическое) деление текста.
Правда, что делать - бросать цветы или помидоры, я не знаю. Дело в том, что еще, кажется, в восьмидесятых годах замечательный ученый, классик нашего языкознания М.Я. Блох дополнил теорию уровней языка новой единицей - диктемой, т.е. минимальной единицей уровня тематизации. Диктема может быть образована одним или несколькими предложениями, и таким образом совпадать по объему с абзацем. На мой взгляд, микротема и диктема - есть одно понятие.
Правда, есть еще термин "сверхфразовое единство", однако этот термин не решает проблемы абзаца (или тематического целого), состоящего лишь из одного предложения.