В первую очередь общим было, конечно, наличие колоний - и у Испании, и у Португалии были колонии в Южной Америке и Африке. Эти территории были поделены на отдельные административные единицы, где власть принадлежала чиновникам, присланным из метрополий.
Основное же отличие состоит в том, что в Испании, в отличие от Португалии, не было распространено рабовладение.