Часто козёл применяется не столько в неприязни, сколько в обвинении человека в предательстве. Я читал, что на некоторых скотобойнях животных заводил козёл дрессированный, который шел впереди, животные при этом были спокойны и не настолько стрессуют, что благополучно на качестве мяса сказывается. Так что может отсюда.
Еще же козёл это животное олицетворение Сатаны в христианской культуре.