Хуже не будет: законом предусмотрен определенный порядок привлечения работников к дисциплинарной ответственности, задним числом сделать это не получится.
Жаловаться можно в инспекцию труда и прокуратуру, однако сейчас эти организации проверки частных компаний не проводят. Могут только «побеседовать» с работодателем и убедить добровольно исправить нарушения.
Если Вы не подавали заявление на увольнение по собственному желанию - необходимо свои права защищать. В случае, если Вы убедите суд в своей правоте - будете восстановлены на работе и получите компенсацию за вынужденный прогул.
Срок подачи искового заявления - 30 дней с момента получения приказа об увольнении (или трудовой книжки). Так что не затягивайте с написанием и подачей заявления!