Как восстановить фото в WhatsApp, если папка WhatsApp удалена на телефоне, а через резервное копирование не получается?

Скорее всего, никак. Фотографии WhatsApp нигде централизованно не хранятся - только на устройствах пользователей. Можно попросить собеседников, с которыми вы обменивались фото, снова вам их прислать.