В общем случае они влияют на сглаживание данных.
Чем шире окно, тем больше сглаживаются данные.
А вот конкретный вид ядра может и больше сгладить данные и меньше.
Вид ядра выбирается под конкретную задачу. Например, для уменьшения влияния шумов используется гауссовское ядро. А для учета снижения влияния прошлых данных во временных рядах используется ядро с экспоненциальным средним.