Мой ответ прозвучит банально: в зависмости от предназначения классификатора. Он должен успешно решать ту задачу, которую перед ним поставили.
Допустим, классификатор получает на вход данные прочтения генома здорового человека и должен сказать - а нет ли там каких-нибудь "поломок", которые потом вылезут в ходе жизни. Если такой классификатор даст слишком много ложноположительных предсказаний, то врач-генетик, проверяющий его результаты, сойдëт с ума в попытке разобраться в потоке данных. Геном-то большой, там миллиарды нуклеотидных позиций.
А вот та же самая задача, то же прочтение генома - но человек больной, у него симптомы, и нужно поставить ему диагноз. Здесь недопустимы ложноотрицательные результаты, а вот ложноположительные можно и потерпеть - главное, найти конкретный "дефект" в тех генах, которые могут быть связаны с этой болезнью.