Такая рекомендация имеет смысл, т.к. во время процедур в глаз могут попадать различные инородные вещества - частички, раствор и т.п.
При этом при моргании они не удаляются из глаза, а могут попадать под линзу или впитываться её поверхностью.
С другой стороны - контактна линза в этом случае может выполнять защитную функцию, но после процедуры наращивания ресниц желательно её заменить.