Почему Я.Вебмастер показывает, что статьи сайта некачественные и удалены из поиска? Но они есть в поиске и находятся на тех же местах.

Потому что обновления в браузере произойдут через месяц-два. Ориентируйтесь на то, что говорит Вебмастер. Проверяйте качество статей через проверенные ресурсы.