Есть ли данные о том, сколько индейцев было уничтожено в ходе конкисты?

Вообще смотря что считать конкистой. Конкретные испанские экспедиции определенного периода или в целом стартовый период исследования и освоения Антил, юга северной и целиком центральной и южной Америки. Я бы сказал что прямые боевые потери которые б\м можно прикинуть - в разное время в разных местах - от нескольких тысяч максимум до пары десятков тысяч минимум, в сумме в пределах тыщ двухсот на все испанские экспедиции от конца 15 века до конца 16. Слишком маленькие численности сражались со стороны испанцев. А со стороны индейцев - обычно в несколько раз бОльшие максимум. Параллельные потери, включая нон-комбатантов, от болезней, релокаций, голода, стресса и тд сложней прикинуть, тыщ 500 с лишним может быть, может и до миллиона. В целом за период.

Но так жили и воевали вообще все на всех континентах тогда. При этом огромное число индейцев было вовлечено в события на стороне конкистадоров и участвовали по сути в гражданских и межплеменных войнах, которые периодически происходили без всяких колонизаторов и были всегда крайне разрушительны. При этом в относительно "мирное" время индейцы постоянно повоевывали, соревновались в ритуальных играх насмерть, приносили человеческие жертвы и прочими способами "регулировали" свою численность.

Эпидемии и бойни в америке не конкистадоры придумали и исторически огромная часть погибших во время конкист индейцев была бы все равно обречены на насильственную смерть. При этом в период конкисты сложно найти примеры полного истребления какого-либо племени. Кроме Антил. И наоборот легко найти примеры сохранения многочисленности у вроде как сильно пострадавших народов в ближайшие после конкисты периоды.

По интуитивному восприятию сильнее всего пострадавшие во время конкисты народы империй ацтеков и инков никогда после этого не выглядели "истребленными" или малочисленными. И даже кубинские или гаитянские таино какие-нибудь не были поголовно убиты, скорей растворились в ходе этногенетических процессов, утратив идентичность.

И по еще одному интуитивному ощущению уже латиноамериканские независимые от Испании режимы набили индейцев в целом гораздо больше, в том числе руками индейцев бывших гражданами этих режимов. Не считая неизвестно огромного числа индейцев Латинской Америки убитых в ходе между-индейских конфликтов за любой статистический период. Не считая Бразилии и прилегающих регионов соседних стран, которые вплоть до недавнего времени истребляли индейцев руками армии и бандитов, зачищая сельву и прочие глухие места.

Для этого нужно точно знать, сколько индейцев было до...

Но любая официальная цифра будет очень не достоверна.

Если не лжива.

Поэтому...кроме самого факта конкисты, все остальные "точные данные" ничтожны.

Потому что официальной переписи населения у индейцев, естественно, не было.