Все наблюдения кварков косвенные. Берем какой-нибудь протон и фигачим посильнее о другой протон. Один из них (или оба) разлетаются на кварки. Но т.к. кварки сами по себе не существуют (конфайнмент!), то они неизбежно слепятся хотя бы по два. Эти промежуточные частицы (мезоны) летят по каким-то характерным траекториям (в зависимости от кваркового состава), взаимодействуют с другими продуктами распада (в зависимости от кваркового состава), и в итоге формируют что-то более или менее детектируемое, на основании чего и делается вывод, о каких кварках изначально шла речь. Напрямую их не регистрируют.
К примеру, в процитированном из Вики отрывке речь идет о регистрации димюонного резонанса. Это, как я понимаю, когда в процессе протон-протонного столкновения и всей цепочки последующих превращений в итоге образуется пара мюон-антимюон, находящихся в резонансе, который и регистрируется. Если резонанс происходит на определенном энергетическом уровне, соответствующем расчетному, то это считается подтверждением существования кварка. Более детально объяснить не смогу - не специалист.