Как учитывать в бух.учете подарочные сертификаты которые мы продаем и принимаем к оплате за комиссионный товар.

Про сами подарочные сертификаты в бухучете ничего не сказано. Можно их приравнять в авансовым платежам (если посчитать как предварительную оплату за еще не оказанные услуги) и тогда сформировать проводки:

Д 50 К62 (с аналитикой авансовые платежи) - при продаже сертификата;

Д 62 К 62 (авансовые платежи) - при зачете подарочного сертификата в качестве услуги;

Д 62 К 90 (выручка) - одновременно с предыдущей проводкой;

можно еще отдельно их учитывать на забалансовом счете 006 (но это по желанию).

Пример я написала для УСН (с учетом освобождения от НДС).