Начнем с того, что СНТ - это организационно-правовая форма юридического лица, созданного для содействия ведения садоводства, а ИЖС - это земельный участок, вид разрешенного использования которого - индивидуальное жилищное строительство.
Скорее всего, под СНТ вы имели ввиду земельные участки, вид разрешенного использования которого - для садоводства, и соответственно расположение на территории СНТ.
Теперь к ключевым отличиям:
В ИЖС не нужно платить взносов, в отличии от СНТ, где у вас будут обязательные взносы, являющиеся по сути коммунальными платежами;
В ИЖС нет председателя, как СНТ, с которым нужно будет взаимодействовать, просить у него бумаги или подпись на межевание;
В ИЖС коммуникации (подъездная дорога, столбы линий электропередач) обслуживаются за счет муниципального образования, а в СНТ это общее имущество товарищества и за обслуживание платите в том числе вы, как собственник участка на территории.
В ИЖС в отличии от СНТ не может быть закрытой территории и шлагбаума со въездом только для своих;
В ИЖС в отличии от СНТ довольно трудно подобрать участок, где окружение будет примерно того же социального уровня;
В принципе базово это основные отличия, если не вдаваться в совсем юридические нюансы.
Еще важный момент, что все новые "коттеджные поселки" - это СНТ, если смотреть на документы планировки территории.
Какой бы выбор вы не сделали, мы советуем обращаться к профильным юристам для консультации по конкретному объекту и оценке рисков тех или иных вариантов.
Поверьте, нюансов там хватает)
И самое главное отличие СНТ от ИЖС - в домах, расположенных на земельных участках ИЖС можно прописаться в любом случае. А если дом на участке в СНТ, то прописаться не возможно. Только если участок с видом разрешенного использования "для СНТ (ДНТ) не находится в черте населенного пункта. Подробные объяснения можно узнать в этой статье