Номера должны скопироваться без проблем, можно так же попробовать вставить симку в другой телефон и посмотреть, что он найдет.
Так же есть вариант использовать кардридер и вычитать нужные ячейки. Может подойти PySimReader, или GUI версия monosim.
Если сим-карта была отключена оператором, то вряд ли номера куда-то пропали. Попробуйте переместить их так же, как и если сим-карта работающая.