Добрый день
Здесь все зависит от объема операций и запланированного на эти расходы бюджета.
Удобнее всего вести учет доходов и расходов в программе 1С. Но лицензия данного продукта довольно дорогая и не всем предпринимателям по карману.
«Контур Эльба» – удобное ПО, которое предоставляет доступ к ресурсу не только посредством компьютера, но и через приложение на телефоне. Обладает широким спектром возможностей начиная от выписки первички, заканчивая формированием отчетности, в т.ч. для ИП-работодателей.
Если Вы на УСН, то можете воспользоваться решениями банков, например, бухгалтерия для Ип от Сбербанк онлайн.
Если денег совсем нет, можно вести весь учет в эксель. Для упрощения работы можно создать файл с макросами и формулами.
Обзор программ для ведения учета доходов и расходов см. здесь
Обзор бесплатных решений для УСН - см. в этом материале.