Если бы демона Максвела вообще можно было бы реализовать, то да, скорее всего, проще. Заряженными частицами манипулировать легче.
А дальше возникает принципиальный вопрос, связанный с законами сохранения энергии и вторым законом термодинамики. В замкнутой системе локально можно создать градиент температур - холодильник делает это на раз. Но холодильнику нужно электричество извне, чтобы работать. Точно также и демону Максвела нужна энергия для подпитки, а в замкнутой системе её взять неоткуда - закон сохранения.