Если у бывшего президента РФ пожизненная неподсудность и не предусмотрены механизмы её отмены, это означает, что он может делать что хочет?

Теоретически это действительно так, но в случае государственного переворота никто не будет смотреть на эти гарантии, поэтому экс-президента смогут арестовать и судить.