Клубень это видоизмененный побег.
Корнеплод же видоизменный корень.
Как и любой побег клубень имеет почки, листья и стебель. Но так как клубень это не обычный побег, а видоизмененный, то сам клубень представляет собой сильно утолщенный стебель; листья быстро отмирают и на их месте образуются листовые рубцы (бровки), а его почки называют глазками.
Наличие данных структур - главное морфологическое отличие клубня от корнеплода.