Мы пузири убираем нагреванием смолы перед заливкой. Раньше использовали модификаторы, они реально делали смолу более жикой и текучей. Были опыты работы на вибростоле - тоже помогает
Первый раз я заливала гербарий в силиконовую форму, пузырьков не было. Получила второй раз смолу ту же самую и при заливке -О УЖАС! вся смола в очень мелких пузырьках как пыль, а при заливке я не видела. Странно, теперь не знаю в чем причина и как этого не допустить.
Можно разрогреть эпоксидную смолу газовой горелкой или использовать специальный корректор на основе растворителя, который тоже неплохо убирает пузыри с поверхности.