Я б посоветовала, поставить хороший фильтр на воду, а потом ещё приобрести серебрянный кувшин в котором воду можно отстаивать и обеззараживать,
тем-более кувшин из серебра будет не просто на страже вашего здоровья, а ещё будет шикарным украшением дома https://etno-shop.ru/catalog/serebryanye_kuvshiny/
Если загрязнилась вода в колодце, то его надо чистить.
Это можно сделать самостоятельно (если колодец неглубокий) или с помощью специальных рабочих (уточняйте цену на работу).
Если речь про водопроводную воду - то лучше воспользоваться фильтром. Можно простой фильтр-кувшин, а можно и встроить его во внутреннюю систему крана.