Как говорит в комедии сама Софья о молчалине:
"...уступчив, скромен, тих,
В лице ни тени беспокойства,
И на душе проступков никаких,
Чужих и вкривь и вкось не рубит, —
Вот я за что его люблю".
Кроме того. Софье в силу ее характера хочется, чтобы мужчина был слабее ее, чтобы она могла им управлять. И ей кажется, что это Молчалин.
Тут недоконца начала нет
Софья ценит в нем скромность, уступчивость, неразговорчивость, то, что Молчалин не судит и не критикует других людей, поэтому выглядит добрым. Также ей нравится, что он всегда рядом сколько угодно времени, может просидеть всю ночь напролет за разговорами и не сводя с нее глаз.