Защита от средств РЭБ весьма сложная задача.
Если упрощенно, то необходимо:
во-первых, полностью экранировать приемо-передающий блок аппарата от воздействия внешних излучений - в идеале поместить всю электронику в клетку Фарадея. На практике это значит, что аппарат должен иметь не частично, а полностью проводящий корпус.
во-вторых, антенна, которая в любом случае будет торчать снаружи, должна быть узконаправленной и смотреть всегда на антенну пункта управления. Поскольку аппарат совершает маневры, то антенна должна иметь следящую систему и привод, который бы поворачивал ее в нужную сторону при маневрировании аппарата.
в-третьих, неплохо бы использовать в качестве команд управления шумоподобные сигналы, и приемник с большим динамическим диапазоном, чтобы он не забивался ни заградительными, ни прицельными помехами.
Как понимаете, все это реализовать на борту простого дрона проблематично.