Одно значение слова "церковь" - здание, где проводят христианские богослужения. Другое значение - религиозные организации и сообщество верующих в целом (например, Православная церковь, Католическая церковь).
Вообще-то слова ЦЕРКОВЬ,ЦИРК,ЦИРКУЛЬ от одного корня,означающего КРУГ.