На самом деле, студий не так уж и мало, вот только где годная анимация.
Из тех, что знаю:
Wizart Animation ("снежная королева")
Мельница (куда же без нее)
Пилот (сейчас почти ничего не выпускает)
Анимаккорд ("маша и медведь")
Аэроплан ("фиксики")
Союзмультфильм (современный)
Студия Ивана Максимова (авторские короткометражки)