Тут вопрос в том, как измерять опасность. Самый популярный вариант - это использовать LD50, то есть дозу, при которой погибает 50% подвергнутых воздействию. Чем меньше эта доза, тем более ядовитым считается вещество. Наименьшие дозы вообще характерны для веществ, нацеленных на нервную систему - потому что нейронов у нас мало в организме по сравнению с другими клетками, но их функция очень важна.
Среди искуственно синтезированного химического оружия наименьшим LD50 обладают фосфороорганические ингибиторы холинестераз, в частности, VX- газы.
Если же брать вещества природного происхождения, то самым опасным из них (и вообще из известных человечеству ядов) является ботулинический токсин. Точнее, токсины, это группа белков.