Купил электронный билет в аэрофлоте, прислали на почту онлайн регистрацию, сначала выбрал места, а потом отказался. Мой билет действует?

Да! Регистрация на рейс и последующий отказ от выбранного места не лишает вас возможности совершить перелет в соответствии с купленным билетом у авиаперевозчика.

Скорее всего вы не завершили онлайн регистрацию и ее нужно будет пройти на стойке в аэропорту. Но на сам билет это повлиять никак не должно было.