Купили зеленый лук в горшочке, но между стеблями было много как будто синих камешков, похожих на гречку, пустых внутри. Что это может быть?

Это оболочки от удобрений длительного действия. Их кладут во время посадки в горшок. Затем оболочки постепенно лопаются под воздействием влаги, освобождая микродозы удобрений.