Название говорит само за себя - она основана на различных комбинациях генов. В основе комбинативной изменчивости лежит половое размножение организмов, вследствие которого возникает огромное разнообразие генотипов.
Главные источники комбинативной изменчивости - независимое расхождение гомологичных хромосом в 1 редукционном делении (1 мейоз), рекомбинация генов и случайная встреча гамет.