Почему ребенок плачет, когда просыпается?

Плач после сна называют инерцией. Это нормальное явление.

Если говорить простым языком, мозг входит в состояние бодрствование.

Мозг действительно «включает» все функции. Некоторая задержка вызывает инерцию -заторможенное состояние.

Дети могут:
✔плакать после пробуждения,
✔иногда сильно кричать,
✔с трудом реагировать на вашу помощь.
⠀
Через некоторое время малыш будто «выключается» и все проходит.
⠀
Инерция у ребенка может длиться от пары минут до 20 минут.
⠀
Состояние инерции считается нормой.
У детей первых лет жизни случается часто.
⠀
Но обязательно нужно исключать, что есть иные причины.
Интенсивность эпизодов, длительность и частота-повод поговорить с педиатром.
⠀
С возрастом частота инерции, как правило, сокращается.
⠀
Риск инерции повышает:
✔переутомление,
✔хронический дефицит сна,
✔излишняя стимуляция до сна -перевозбуждение,
✔этапы в развитии ребенка (кризисы, навыки, скачки),
✔ если сон закончился не естественным образом, а от внешнего пробуждения в неподходящий момент.
Подробнее в статье.

Ну, если он еще не может вам сказать почему плачет, то нужно проверить все по стандарту: подгузник, может он хочет кушать, или например, у него зателка ручка или ножка, но он же не может понять, что это пройдет.