На мой взгляд, при создании общих правил русского языка, люди сталкивались с такой проблемой как разного рода указы правителей, ну и писаниями летописцев. И проблема была в том что когда какой нибудь филолог Кирилл создавал правило, про -ан, -ян, -енн, и хотел внести его в массы, его вызывал правитель страны и убедительно разъяснял что он вчера в своем указе или документе, везде написал деревянные, стеклянные оловянные, и если люди будут читать документ, то подумают что он безграмотный царь и засмеют, поэтому у Кирилла было два выхода, либо внести исключения, либо на кол.