Как человек, много лет отдавший детской психиатрии и неврологии, могу сказать что среди неврологов и психиатров Петербурга, наоборот, почти никто не говорит "эпилепсИя", только "эпилЕпсия". И это как рази есть отраслевое искажение.
А остальные врачи говорят по нормам греческого языка, откуда заимствовано слово -- "эпилепсИя".
А обыватели, видимо, узнают это слово от психиатров, а не от преподавателей латинского языка и мединской терминологии :)