Да могут существовать нормы, которые противоречат друг другу. Например, ДПЧ говорит о свободе собраний, а закон РФ ограничивает эту свободу, заставляя получать разрешения.
На моральных ценностях обычно и строится право.
В идеале так быть, конечно же, не должно, но на практике подобные "несостыковки" встречаются буквально на каждом шагу. Этот феномен можно охарактеризовать тремя словами "несовершенство правовой системы". Возможно, причина в огромном количестве законов и поправок, некоторые из которых плохо уживаются с уже существующими нормами.