У меня iPad с указанием автоматического обновления ПО,но почему-то он не обновил версию iOs 9.3.В чем проблема?

Без указания точной версии iPad дать вам достоверный ответ достаточно не просто, дело в том, что ваше устройство возможно вообще не поддерживает обновление до версии превышающей 9.3

Нужно убедиться что ваш iPad поддерживает обновление и более новую iOS!! В вашем случае, наверняка 9.3 это последняя версия прошивки конкретно для вашего планшета и обновляться она больше не будет