Достоверных свидетельств их встречи нет. Есть "свидетельства", при проверке оказывающиеся абсолютным вымыслом. Из членов семьи Ленина царю (Александру Третьему) писали прошение о помиловании его брат Александр Ульянов и его мать по тому же поводу. Есть доказательства, что царь знакомился с прошением лично. Это единственная связь между семьями Ульяновых и Романовых.
Миф на то и миф, что недоказуем в принципе. Начинаем копать, а получаем пустышку. Достаточно посмотреть на биографию матери Ленина, чтобы убедиться: вероятность ее знакомства с царем близка к нулю. Начинаем копать еще глубже и версия рассыпается: фрейлиной не была и т. д.
Почти уверен, что никогда не встречались лично. Да и как они могли встретиться? Ленин либо в ссылке, либо в эмиграции. Полагаю, что Николай второй только слышал о нем. Возможно, что-то из его статей читал.