Да, можно, это не запрещено законодательными актами. Однако, будет тяжело поступать. Так как сейчас в магистратурах, в приличном их количестве есть конкурс портфолио по теме магистратуры.
НО, есть и хорошие новости, есть еще вступительные испытания и зачисления по ним, и если хорошо подготовиться то можно вполне поступить на магистратуру по другому профилю и на бюджет