Мюонами сканировать Луну не получится потому, что нет потока мюонов в составе первичного потока космических лучей. Слишком мало время жизни мюонов (~ 2 мкс). Однако, есть несколько похожих проектов, касательно космических лучей и Луны.
Нейтринное свечение Луны. Проект предлагает российская группа учёных (см. здесь). Первичные космические лучи высоких энергий постоянно бомбардируют поверхность Луны, создавая ядерно-электромагнитные каскадные ливни в реголитовом слое Луны. Большинство вторичных частиц поглощается веществом Луны, тогда как мюонные и электронные нейтрино (антинейтрино) с энергиями менее 1 ГэВ, рождённые от распадов короткоживущих мезонов и мюонов, успешно проходят через толщу вещества Луны и могут быть зарегистрированы нейтринными детекторами на Земле в форме нейтринного "свечения" Луны. Проект может быть реализован на детекторах серии Kamiokande.
Нейтринная тень Луны. Этот проект реализован в эксперименте IceCube (Антарктида, система из более 5000 оптических детекторов (фотоумножителей), установленных в толще льда на глубинах 1500 ÷ 2500 м). Первичное космическое излучение сверхвысоких энергий, поглощённое полностью Луной, создаёт дефицит нейтрино в направлении Луны, что регистрируется детекторами и позволяет провести абсолютную калибровку точности восстановления углов траекторий детектируемых нейтрино. Нейтринная тень Луны, полученная в эксперименте IceCube, показана на рис. ниже.
Из неопубликованных проектов (дискуссии с коллегами). Космические лучи ультравысоких энергий (~ 100 ПэВ), взаимодействуя неглубоко в поверхностном реголитовом слоем Луны, создают мюоны (от распада пионов) с энергиями более 1 ПэВ, которые из-за релятивистского удлинения времени жизни (t₁ = γt₀), могут долететь до Земли и зарегистрироваться. Пока никто не взялся реализовывать этот проект, по-видимому, из-за чрезвычайно малой ожидаемой интенсивности таких мюонов.