Нет ошибки. В волноводах возможны два типа волн : TE - поперечные электрические (в них магнитное поле направлено вдоль волновода) и TM - поперечные магнитные, в которых электрическое поле направлено вдоль волновода. Называть последние продольными можно, но это не отражает сути. В обоих типах волн магнитное и электрическое поле перпендикулярны друг другу ( с оговоркой о влиянии границ). В любом случае поля в волноводе меняются поперек него и если частота такова, что поперечный размер волновода близок к половине волны, то фазовая скорость стремится к бесконечности а групповая к нулю. На критической частоте колебания вдоль волновода синфазны, то есть фазовая скорость бесконечна, а ниже критической частоты волновое число становится мнимым, что соответствует продольно-локализованным колебаниям.
Фаза отраженного импульса не означает неизменность направления потока энергии, нужно учитывать и фазу магнитного поля.
Язык математики позволяет моделировать физические процессы. Но не всякие конструкции этого языка являются моделями реальных физических процессов. Вероятно, ошибка в том, что Вы этого пытаетесь не учитывать.