Ферментативный гидролиз, как видно из названия катализируется ферментами в отличии от гидролиза кислотного или щелочного, который происходит при воздействии на материю кислотами и щелочами. Ферменты обладают селективностью по отношению к биологическим соединениям. Сказать лучше или хуже нельзя, так как у каждого процесса своя функция.