Здравствуйте
Если военкомат направил вас на дополнительное обследование, но вы не успеваете его пройти в установленные в повестке сроки, то как правило проблем возникать не должно, так как опаздываете вы не по своей вине (вы умышленно не игнорируете военкомат), это связано с медицинским учреждением.
Важно только помнить, что возвращаться в военкомат следует с основанием на отсрочку, иначе вас могут призвать