Здравствуйте.В случае изменения прописки вы должны по закону в течении 14 дневный срок прийти свой военный комиссариат и сняться с воинского учета.
Однако, на практике достаточно прийти в новый военкомат и подать заявление о постановке на воинский учёт и военный комиссариат сам поставит вас на учёт и запросит личное дело призывника со старого военкомата.
С этого момента, как вы встанете на воинский учёт в новый военкомат- вы должны проходить призывные мероприятия ( в том числе медкомиссию) только в нем, к старому военкомату вы уже не будете относиться.