Здравствуйте.Если вы встали на воинский учёт, новый военный комиссариат должен запросить ваше личное дело со старого военкомата и после этого вы уже не будете относиться к нему.
Они это сделали?.
Если да, тогда просто скажите им по телефону, что встали на воинский учёт по месту вашего фактического пребывания.
Вопросы к вам должны отпасть.
Если личное дело ещё не запросили со старого военкомата, тогда понятно почему продолжаются сообщения.
Попросите или напишите заявление о постановке на учёт в новый военкомат и они его запросят