Вводите вместо своего логина в Яндексе тот самый, который вы прикрепили. Таким образом вы попадаете в тот самый почтовый ящик. То есть входом для почты для домена является тот же самый вход в почту яндекса, что и для обычного аккаунта. Не забывайте, что в логине нужно указывать полный почтовый адрес (с доменом).
В организации перейдите в админку и добавьте нового пользователя: введите данные, логин (то, что будет указываться в почте до @), придумайте пароль итд.
Теперь вы можете войти через данного пользователя в Яндекс и уже пользоваться почтой с собственным доменом.
Важно понимать, что сама организация ( типа all@example.com) письма принимать и отправлять не может.