В сентябре климат в Балыксе можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Балыксе 13 дождливых, 9 ясных, 7 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Балыкса cчитается местом, некомфортным для посещения.