В сентябре климат в Когалыме можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Когалыме 16 дождливых, 13 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Когалым cчитается местом, некомфортным для посещения.