В сентябре климат в Малегаоне можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 27 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малегаоне 24 дождливых, 4 ясных, 1 пасмурный и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в июне, июле и августе Малегаон cчитается местом, некомфортным для посещения.